物理化学学报 >> 1999, Vol. 15 >> Issue (11): 1011-1016.doi: 10.3866/PKU.WHXB19991111
计明娟, 叶学其, 杨鹏程
Ji Ming-Juan, Ye Xue-Qi, Yang Peng-Cheng
摘要:
用高温淬火分子动力学模拟方法研究了甲硫氨酸-脑啡肽(Met-enkephalin)在真空中的构象性质. 经聚类分析和能量优化得到了十三个低能构象, 并与吗啡进行了空间拟合. 模拟结果表明,Met-enkephalin是一种构象柔性大的多肽分子, 可具有多种构象, 主要为Gly2-Gly3和Gly3-Phe4之间的β-折叠型式. 大多数的结构具有由氢键连接两个末端残基所形成的假大环, 侧链和芳香环定位在假大环的同侧. 模拟结果还表明,模型最大的特征是:酪氨酸残基中的氨基N相当于吗啡中哌啶环上的季胺N, 酪氨酸残基中的酚环相当于吗啡中的酚环, 苯丙氨酸残基中的芳香环相当于吗啡中环己烯环. 此肽与吗啡在空间结构(药效基团)上非常相似, 都满足阿片受体的要求. 所以,它们可作用于同一受体. 该模型也能为具有阿片效能的肽和非肽配体的药效团设计提供帮助.