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物理化学学报  2006, Vol. 22 Issue (03): 388-390    DOI: 10.3866/PKU.WHXB20060327
研究简报     
三维原子场作用全息矢量用于二氢叶酸还原酶抑制剂及苦味二肽QSAR研究
梁桂兆; 梅虎; 周鹏; 周原; 李志良
重庆大学化学化工学院; 重庆大学生物力学与组织工程教育部重点实验室, 重庆 400030
Study on Quantitative Structure-Activity Relationship by 3D Holographic Vector of Atomic Interaction Field
LIANG Gui-Zhao; MEI Hu; ZHOU Peng; ZHOU Yuan; LI Zhi-Liang
College of Chemistry and Chemical Engineering; Key Laboratory of Biomechanics and Tissue Engineering, Chongqing University, Chongqing 400030, P. R. China
 全文: PDF(1334 KB)   输出: BibTeX | EndNote (RIS) |
摘要: 将三维原子场作用全息矢量用于表征68个二氢叶酸还原酶抑制剂和48个苦味二肽结构, 分别以多元线性回归和偏最小二乘建模, 取得优良结果. 对前者建模得复相关系数Rmm2=0.893, 交互检验相关系数RCV2=0.853, 对后者建模得Rmm2=0.936, RCV2=0.849. 结果表明3D-HoVAIF能够较好表征两类分子结构, 具有物化意义明确及结果易解释特点, 值得进一步应用推广.
关键词: 三维原子场作用全息矢量定量构效关系二氢叶酸还原酶苦味二肽多元线性回归    
Abstract: A novel method based on three-dimensional holographic vector of atomic interaction field (3D-HoVAIF) was employed to express 3D structures of 68 dihydrofolate reductase (DHFR) inhibitors and 48 bitter tasting thresholds (BTT). Better model was developed based on multiple linear regression (MLR) through a stepwise manner for DHFR and genetic arithmetic-partial least square for BTT, and the following results were obtained: the multiple correlation coefficient (Rmm2) of 0.893 and 0.936, the cross validated RCV2 of 0.853 and 0.849 by the leave-one-out procedure, respectively. atisfactory results showed that information related to biological activities of DHFR and BTT can preferably be expressed by 3D-HoVAIF with definite physical and chemical meaning, easy interpretation, and well understanding, which may become a useful structural expression technique to study quantitative structure-activity relationships (QSAR) for various bioactive substances.
Key words: 3D-HoVAIF    QSAR    DHFR    BTT    MLR
收稿日期: 2005-07-18 出版日期: 2006-03-10
通讯作者: 李志良     E-mail: zlli2662@163.com
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梁桂兆
梅虎
周鹏
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梁桂兆;梅虎;周鹏;周原;李志良. 三维原子场作用全息矢量用于二氢叶酸还原酶抑制剂及苦味二肽QSAR研究[J]. 物理化学学报, 2006, 22(03): 388-390, 10.3866/PKU.WHXB20060327

LIANG Gui-Zhao; MEI Hu; ZHOU Peng; ZHOU Yuan; LI Zhi-Liang. Study on Quantitative Structure-Activity Relationship by 3D Holographic Vector of Atomic Interaction Field. Acta Phys. -Chim. Sin., 2006, 22(03): 388-390, 10.3866/PKU.WHXB20060327.

链接本文:

http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/10.3866/PKU.WHXB20060327        http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/Y2006/V22/I03/388

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