(1) Yu, X.;Wang, Q.; Lin, Y.; Zhao, J.; Zhao, C.; Zheng, J.Langmuir 2012, 28, 6595. doi: 10.1021/la3002306
(2) Wu, Y.; Han,W.;Wang, D.; Gao, Y.; Zhao, Y. Accounts Chem.Res. 2008, 41, 1418. doi: 10.1021/ar800070b
(3) Beke, T.; Csizmadia, I. G.; Perczel, A. J. Am. Chem. Soc. 2006,128, 5158. doi: 10.1021/ja0585127
(4) Karlsson, A. J.; Pomerantz,W. C.;Weisblum, B.; Gellman, S.H.; Palecek, S. P. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12630. doi: 10.1021/ja064630y
(5) Pomerantz,W. C.; Abbott, N. L.; Gellman, S. H. J. Am. Chem.Soc. 2006, 128, 8730. doi: 10.1021/ja062412z
(6) Montalvo, G.;Waegele, M. M.; Shandler, S.; Gai, F.; DeGrado,W. F. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 5616. doi: 10.1021/ja100459a
(7) Hamm, P.;Woutersen, S.; Rueping, M. Helv. Chim. Acta 2002,85, 3883. doi: 10.1002/1522-2675(200211)85:11<3883::AID-HLCA3883>3.0.CO;2-G
(8) Scheurer, C.; Piryatinski, A.; Mukamel, S. J. Am. Chem. Soc.2001, 123, 3114. doi: 10.1021/ja003412g
(9) Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Protein Chem. 1986, 38, 181. doi: 10.1016/S0065-3233(08)60528-8
(10) Dong, A.; Huang, P.; Caughey,W. S. Biochemistry 1990, 29,3303. doi: 10.1021/bi00465a022
(11) Kim, Y. S.;Wang, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B2005, 109, 7511. doi: 10.1021/jp044989d
(12) Ganim, Z.; Chung, H. S.; Smith, A.W.; DeFlores, L. P.; Jones,K. C.; Tokmakoff, A. Accounts Chem. Res. 2008, 41, 432. doi: 10.1021/ar700188n
(13) Wang, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 5310. doi: 10.1039/b900063a
(14) Luo, J.;Wu, F.; Yu, J.;Wang, R.; Yu, Z. J. Phys. Chem. B 2011,115, 8901. doi: 10.1021/jp200296v
(15) Remorino, A.; Hochstrasser, R. M. Accounts Chem. Res. 2012,45, 1896. doi: 10.1021/ar3000025
(16) Jackson, M.; Haris, P. I.; Chapman, D. Biochimica et BiophysicaActa (BBA)-Protein Structure and Molecular Enzymology 1989,998, 75. doi: 10.1016/0167-4838(89)90121-0
(17) Zanni, M. T.; Asplund, M. C.; Hochstrasser, R. M. J. Chem.Phys. 2001, 114, 4579. doi: 10.1063/1.1346647
(18) Khalil, M.; Demirdoeven, N.; Tokmakoff, A. J. Phys. Chem. A2003, 107, 5258. doi: 10.1021/jp0219247
(19) Asbury, J. B.; Steinel, T.; Fayer, M. D. J. Phys. Chem. B 2004,108, 6544. doi: 10.1021/jp036600c
(20) Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104,14190. doi: 10.1073/pnas.0704079104
(21) Li, D.; Yang, F.; Han, C.; Zhao, J.;Wang, J. J. Phys. Chem. Lett.2012, 3, 3665.
(22) Qian,W.; Krimm, S. J. Phys. Chem. 1993, 97, 11578. doi: 10.1021/j100147a003
(23) Frisch, M. J.; Trucks, G.W.; Schlegel, H. B.; et al. Gaussian 09,Revision A.02; Gaussian Inc.: Pittsburgh, PA, 2009.
(24) Phillips, J. C.; Braun, R.;Wang,W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid,E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K.J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781. doi: 10.1002/jcc.20289
(25) MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.;Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha,S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T.K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom,B.; Reiher,W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.;Stote, R.; Straub, J.;Watanabe, M.;Wiorkiewicz-Kuczera, J.;Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586.
(26) Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.;Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577. doi: 10.1063/1.470117
(27) Martyna, G. J.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1994,101, 4177. doi: 10.1063/1.467468
(28) Feller, S. E.; Zhang, Y.; Pastor, R.W.; Brooks, B. R. J. Chem.Phys. 1995, 103, 4613. doi: 10.1063/1.470648
(29) Bour, P.; Keiderling, T. A. J. Chem. Phys. 2003, 119, 11253. doi: 10.1063/1.1622384
(30) Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2247. doi: 10.1063/1.1580807
(31) Schmidt, J. R.; Corcelli, S. A.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys.2004, 121, 8887. doi: 10.1063/1.1791632
(32) Hayashi, T.; Zhuang,W.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. A 2005,109, 9747. doi: 10.1021/jp052324l
(33) Lin, Y. S.; Shorb, J. M.; Mukherjee, P.; Zanni, M. T.; Skinner, J.L. J. Phys. Chem. B 2008, 113, 592.
(34) Maekawa, H.; Ge, N. H. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 1434. doi: 10.1021/jp908695g
(35) Wang, L.; Middleton, C. T.; Zanni, M. T.; Skinner, J. L. J. Phys.Chem. B 2011, 115, 3713.
(36) Cai, K.; Han, C.;Wang, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11,9149. doi: 10.1039/b910269h
(37) Beke, T. S.; Somlai, C.; Magyarfalvi, G. B.; Perczel, A. S.;Tarczay, G. R. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 7918. doi: 10.1021/jp9022844
(38) Piryatinski, A.; Skinner, J. L. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 8055.doi: 10.1021/jp0202542
(39) Bagchi, S.; Boxer, S. G.; Fayer, M. D. J. Phys. Chem. B 2012,116, 4034. doi: 10.1021/jp2122856
(40) Wang, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3798.doi: 10.1021/jp0530092
(41) Ghosh, A.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 2011, 390, 1. doi: 10.1016/j.chemphys.2011.07.018
(42) Zhang, Z.; Piatkowski, L.; Bakker, H. J.; Bonn, M. Nat. Chem2011, 3, 888. doi: 10.1038/nchem.1158
(43) Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998,102, 6123. doi: 10.1021/jp9813286
(44) Jimenez, R.; Kumar, P. V.; Maroncelli, M. Nature 1994, 369,471. doi: 10.1038/369471a0 |