(1) Adler, J. Annu. Rev. Biochem. 1975, 44 (1), 341. doi: 10.1146/annurev.bi.44.070175.002013
(2) Adler, J.; Tso,W.W. Science 1974, 184 (4143), 1292. doi: 10.1126/science.184.4143.1292
(3) Hazelbauer, G. L.; Falke, J. J.; Parkinson, J. S. Trends Biochem. Sci. 2008, 33 (1), 9. doi: 10.1016/j.tibs.2007.09.014
(4) Tu, Y. Annual Review of Biophysics 2013, 42, 337. doi: 10.1146/annurev-biophys-083012-130358
(5) Ottemann, K. M.; Xiao,W.; Shin, Y. K.; Koshland, D. E., Jr. Science 1999, 285 (5434), 1751. doi: 10.1126/science.285.5434.1751
(6) Bi, S.; Yu, D.; Si, G.; Luo, C.; Li, T.; Ouyang, Q.; Jakovljevic, V.; Sourjik, V.; Tu, Y.; Lai, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110 (42), 16814. doi: 10.1073/pnas.1306811110
(7) Kim, K. K.; Yokota, H.; Kim, S. H. Nature 1999, 400 (6746), 787. doi: 10.1038/23512
(8) Maddock, J. R.; Shapiro, L. Science 1993, 259 (5102), 1717. doi: 10.1126/science.8456299
(9) Greenfield, D.; McEvoy, A. L.; Shroff, H.; Crooks, G. E.; Wingreen, N. S.; Betzig, E.; Liphardt, J. PLoS Biol. 2009, 7 (6), e1000137. doi: 10.1371/journal.pbio.1000137
(10) Bray, D.; Levin, M. D.; Morton-Firth, C. J. Nature 1998, 393 (6680), 85. doi: 10.1038/30018
(11) Weis, R. M.; Hirai, T.; Chalah, A.; Kessel, M.; Peters, P. J.; Subramaniam, S. J. Bacteriol. 2003, 185 (12), 3636. doi: 10.1128/JB.185.12.3636-3643.2003
(12) Lefman, J.; Zhang, P.; Hirai, T.;Weis, R. M.; Juliani, J.; Bliss, D.; Kessel, M.; Bos, E.; Peters, P. J.; Subramaniam, S. J. Bacteriol. 2004, 186 (15), 5052. doi: 10.1128/JB.186.15.5052-5061.2004
(13) Francis, N. R.; Levit, M. N.; Shaikh, T. R.; Melanson, L. A.; Stock, J. B.; DeRosier, D. J. J. Biol. Chem. 2002, 277 (39), 36755. doi: 10.1074/jbc.M204324200
(14) Zhang, P.; Khursigara, C. M.; Hartnell, L. M.; Subramaniam, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104 (10), 3777. doi: 10.1073/pnas.0610106104
(15) Zhang, C. S.; Lai, L. H. Acta Phys. -Chim. Sin. 2012, 28, 2363. [张长胜, 来鲁华. 物理化学学报, 2012, 28, 2363.] doi: 10.3866/PKU.WHXB201209172
(16) Mintseris, J.; Pierce, B.;Wiehe, K.; Anderson, R.; Chen, R.; Weng, Z. Proteins 2007, 69 (3), 511. doi: 10.1002/prot.21502
(17) Mackerell, A. D., Jr.; Feig, M.; Brooks, C. L., III. J. Comput. Chem. 2004, 25 (11), 1400. doi: 10.1002/jcc.v25:11
(18) Im,W.; Lee, M. S.; Brooks, C. L., 3rd. J. Comput. Chem. 2003, 24 (14), 1691. doi: 10.1002/jcc.10321
(19) Brooks, B. R.; Brooks, C. L., 3rd.; Mackerell, A. D., Jr.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.;Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R.W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.;Woodcock, H. L.;Wu, X.; Yang,W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30 (10), 1545. doi: 10.1002/jcc.v30:10
(20) Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4 (3), 435. doi: 10.1021/ct700301q
(21) Kaminski, G. A.; Friesner, R. A.; Tirado-Rives, J.; Jorgensen,W. L. J. Phys. Chem. B 2001, 105 (28), 6474. doi: 10.1021/jp003919d
(22) Jorgensen,W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79 (2), 926. doi: 10.1063/1.445869
(23) Vaknin, A.; Berg, H. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103 (3), 592. doi: 10.1073/pnas.0510047103
(24) Shimizu, T. S.; Le Novere, N.; Levin, M. D.; Beavil, A. J.; Sutton, B. J.; Bray, D. Nat. Cell Biol. 2000, 2 (11), 792. doi: 10.1038/35041030
(25) Baker, N. A.; Sept, D.; Joseph, S.; Holst, M. J.; McCammon, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98 (18), 10037. doi: 10.1073/pnas.181342398
(26) Gao, Y.;Wang, R.; Lai, L. H. J. Mol. Model. 2004, 10 (1), 44. doi: 10.1007/s00894-003-0168-3
(27) Gao, Y.;Wang, R. X.; Lai, L. H. Acta Phys. -Chim. Sin. 2002, 18, 676. [高莹, 王任小, 来鲁华. 物理化学学报, 2002, 18, 676.] doi: 10.3866/PKU.WHXB20020802
(28) Mowery, P.; Ostler, J. B.; Parkinson, J. S. J. Bacteriol. 2008, 190 (24), 8065. doi: 10.1128/JB.01121-08
(29) Dror, R. O.; Dirks, R. M.; Grossman, J. P.; Xu, H.; Shaw, D. E. Ann. Rev. Biophy. 2012, 41, 429. doi: 10.1146/annurev-biophys-042910-155245
(30) Saunders, M. G.; Voth, G. A. Ann. Rev. Biophy. 2013, 42, 73. doi: 10.1146/annurev-biophys-083012-130348
(31) Guigas, G.; Morozova, D.;Weiss, M. Adv. Protein Chem. Struct. Biol. 2011, 85 143. doi: 10.1016/B978-0-12-386485-7.00004-1
(32) Chen, M. L.;Wang, L. X.; Chen, S. S.; Liu, X. Y. Acta Phys. -Chim. Sin. 2013, 29, 1201. [陈美玲, 汪理想, 陈姗姗, 刘晓亚. 物理化学学报, 2013, 29, 1201.] doi: 10.3866/PKU.WHXB201303202 |