物理化学学报 >> 2010, Vol. 26 >> Issue (06): 1676-1686.doi: 10.3866/PKU.WHXB20100645
ZHANG Yuan, CHEN Ya-Dong, YOU Qi-Dong, ZOU Li-Yun, YANG Yan
摘要:
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标之一. 由于HDACs包含多种亚型, 且各亚型的生理功能存在一定的差异, 其选择性抑制剂的开发已成为当前的研发热点. 我们通过同源模建的HDAC1结构, 与已有的HDAC8晶体结构的活性位点进行比较分析, 探讨了对两者选择性有重要影响的残基, 为基于受体的选择性抑制剂研究提供重要信息. 同时选择了52个HDAC抑制剂, 分别建立了HDAC1、HDAC8的活性值与对接打分值的线性回归模型. 所建的HDAC1和HDAC8的线性构效关系模型的非交叉验证系数R2分别为0.82和0.80, 表明具有一定的统计学意义. 利用所建模型对已设计合成的化合物进行了预测, 预测结果对HDAC1、HDAC8选择性抑制剂的优化改造提供了一定的指导意义.
MSC2000:
O641