注册
ISSN 1000-6818CN 11-1892/O6CODEN WHXUEU
物理化学学报 >> 2017,Vol.33>> Issue(10)>> 2052-2057     doi: 10.3866/PKU.WHXB201750105         English Abstract
DNA的滚环扩增合成研究
刘淑贞, 张志庆, 王芳, 周亭, 王秀凤, 张国栋, 刘婷婷, 张洪芝
中国石油大学(华东)理学院, 山东 青岛 266580
Full text: PDF (1312KB) HTML 输出: BibTeX | EndNote (RIS)

滚环扩增(RCA)反应作为一种简单高效的等温酶促反应,现已发展为核酸扩增领域的新技术,其产物在组装体搭建和多功能材料的制备方面有着广泛的应用。本文采用琼脂糖凝胶、紫外和透射电镜(TEM)等手段,探究了时间、三磷酸脱氧核糖核苷(dNTPs)、酶以及引物的浓度等因素对脱氧核糖核酸(DNA)滚环扩增产物的影响。结果表明:在反应开始的前30 min,RCA产物的长度受时间的影响比较明显;随着dNTPs浓度的提高,RCA产物的链长增长,浓度也不断提高;酶和引物的浓度对滚环扩增产物的长度没有明显影响,但对RCA产物浓度的影响较大,过量的酶致使RCA产物的含量显著下降。



关键词: 滚环扩增技术   核酸   dNTPs   聚合酶   引物  
收稿日期 2017-03-29 修回日期 2017-05-02 网出版日期 2017-05-10
通讯作者: 张志庆 Email: zhangzq@upc.edu.cn

基金资助: 教育部留学回国人员科研启动基金(2014010615),国家自然科学青年基金(21603276,21303267),山东省自然科学基金(ZR2016BL14),中央高校基本科研业务费资助项目

引用文本: 刘淑贞, 张志庆, 王芳, 周亭, 王秀凤, 张国栋, 刘婷婷, 张洪芝. DNA的滚环扩增合成研究[J]. 物理化学学报, 2017,33(10): 2052-2057.
LIU Shu-Zhen, ZHANG Zhi-Qing, WANG Fang, ZHOU Ting, WANG Xiu-Feng, ZHANG Gou-Dong, LIU Ting-Ting, ZHANG Hong-Zhi. Study on the Synthesis of DNA via Rolling Circle Amplification[J]. Acta Phys. -Chim. Sin., 2017, 33(10): 2052-2057.    doi: 10.3866/PKU.WHXB201750105

(1) Ali, M. M.; Li, F.; Zhang, Z. Q.; Zhang, K. X.; Kang, D.; Ankrum, J.A.; Le, X. C.; Zhao, W. A. Chem. Soc. Rev. 2014, 43, 3324. doi: 10.1039/c3cs60439j
(2) Terpe, K. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013, 97 (24), 10243. doi: 10.1007/s00253-013-5290-2
(3) Konry, T.; Smolina, I.; Yarmush, J. M.; Irimia, D.; Yarmush, M. L. Small 2011, 7 (3), 395. doi: 10.1002/smll.201001620
(4) Deng, Z. X.; Tian, Y.; Lee, S. H.; Ribbe, A. E.; Mao. C. D. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 3582. doi: 10.1002/anie.200463096
(5) Wilner, O. I.; Shimron, S.; Weizmann, Y.; Wang, Z. G.; Willner, I. Nano Lett. 2009, 9 (5), 2040. doi: 10.1021/nl900302z
(6) Hamblin, G. D.; Carneiro, K. M. M.; Fakhoury, J. F.; Bujold, K. E.; Sleiman, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134 (6), 2888. doi: 10.1021/ja2107492
(7) Ouyang, X. Y.; Li, J.; Liu, H. J.; Zhao, B.; Yan, J.; Ma, Y. Z.; Xiao, S. J.; Song, S. P.; Huang, Q.; Jie Chao, J.; Fan, C. H. Small 2013, 9(18), 3082. doi: 10.1002/smll.201300458
(8) Yan, J.; Hu, C. Y.; Wang, P.; Liu, R.; Zuo, X. L.; Liu, X. W.; Song, S. P.; Fan, C. H.; He, D. N.; Sun, G. ACS Appl. Mater. Interfaces 2014, 6 (22), 20372. doi: 10.1021/am505913d
(9) Linck, L.; Reiß, E.; Bier, F.; Resch-Genger, U. Anal. Methods 2012, 4, 1215. doi: 10.1039/c2ay05760c
(10) Xue, Q. W.; Wang, Z. G.; Wang, L.; Jiang, W. Bioconjug. Chem. 2012, 23 (4), 734. doi: 10.1021/bc200537g
(11) Akter, F.; Mie, M.; Grimm, S.; Nygren, PÅ.; Kobatake, E. Anal. Chem. 2012, 84 (11), 5040. doi: 10.1021/ac300708r
(12) Zhu, Y.; Wang, H. J.; Wang, L.; Zhu, J.; Jiang, W. ACS Appl. Mater. Interfaces 2016, 8 (4), 2573. doi: 10.1021/acsami.5b10285
(13) Zhao, W. A.; Cui, C. H.; Bose, S.; Guo, D.; Shen, C.; Wong, W. P.; Halvorsen, K.; Farokhzad, O. C.; Teo, G. S. L.; Philips, J.; Dorfman, D. M.; Karnik, R.; Karp, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 2012, 109, 19626. doi: 10.1073/pnas.1211234109
(14) Chen, G.; Liu, D.; He, C. B.; Gannett, T. R.; Lin, W. B.; Weizmann, Y. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137 (11), 3844. doi: 10.1021/ja512665z
(15) Zhang, Z. Q.; Ali, M. M.; Eckert, M. A.; Kang, D. K.; Chen, Y. Y.; Sender, L. S.; Fruman, D. A.; Zhao, W. A. Biomaterials 2013, 34, 9728. doi: 10.1016/j.biomaterials.2013.08.079
(16) Zhao, W. A.; Gao, Y.; Kandadai, S. A.; Brook, M. A.; Li, Y.F. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 2409. doi: 10.1002/anie.200600061
(17) Wu, Z. S.; Zhou, H.; Zhang, S. B.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Anal. Chem. 2010, 82 (6), 2282. doi: 10.1021/ac902400n
(18) Kim, J. H.; Jang, M.; Kim, Y. J.; Ahn, H. J. J. Med. Chem. 2015, 58 (19), 7863. doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b01126
(19) Ye, T.; Chen, J. Y.; Liu, Y. F.; Ji, X. H.; Zhou, G. H.; He, Z.K. ACS Appl. Mater. Interfaces 2014, 6 (18), 16091. doi: 10.1021/am504035a
(20) Chen, A. Y.; Ma, S. Y.; Zhou, Y.; Chai, Y. Q.; Yuan, R. Anal. Chem. 2016, 88 (6), 3203. doi: 10.1021/acs.analchem.5b04578
(21) Ruff, L. E.; Marciniak, J. Y.; Sanchez, A. B.; Esener, S. C.; Messmer, B. T. Nanotechnol. Rev. 2014, 3, 569. doi: 10.1515/ntrev-2014-0010
(22) Liu, D. Y.; Daubendiek, S. L.; Zillman, M. A.; Ryan, K.; Kool, E. T. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118 (7), 1587. doi: 10.1021/ja952786k
(23) Zhu, G. Z.; Hu, R.; Zhao, Z. L.; Chen, Z.; Zhang, X. B.; Tan, W. H. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135 (44), 16438. doi: 10.1021/ja406115e
(24) Lieberman, K. R.; Cherf, G. M.; Doody, M. J.; Olasagasti, F.; Kolodji, Y.; Akeson, M. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132 (50), 17961. doi: 10.1021/ja1087612
(25) Lu, J.; Chen, Y. H.; Liu, D. M.; Ren, W.; Lu, Y. Q.; Shi, Y.; Piper, J.; Paulsen, I.; Jin. D. Y. Anal. Chem. 2015, 87, 10406. doi: 10.1021/acs.analchem.5b02523
(26) Chen, X. Q.; Ye, Y.; Cheng, H.; Jiang, Y. W.; Wu, Y. J. Agric. Food Chem. 2009, 57, 5795. doi: 10.1021/jf9007696
(27) Bajaj, A.; Kondaiah, P.; Bhattacharya, S. Biomacromolecules 2008, 9, 991. doi: 10.1021/bm700930y
(28) Mohsen, M. G.; Kool. E. T. Acc. Chem. Res. 2016, 49 (11), 2540. doi: 10.1021/acs.accounts.6b00417
(29) Lin, C. X.; Wang, X.; Liu, Y.; Seeman, N. C.; Yan, H. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14475. doi: 10.1021/ja0760980

版权所有 © 2006-2016 物理化学学报编辑部
地址:北京大学化学学院 邮政编码:100871
服务热线:(010)62751724 传真:(010)62756388 Email:whxb@pku.edu.cn
^ Top