(1) Choo, Q. L.;Weiner, A. J.; Overby, L. R.; Bradley, D.W.;Houghton, M. Science 1989, 244, 359. doi: 10.1126/science.2523562
(2) (a) Lauer, G. M.;Walker, B. D. N. Engl. J. Med. 2001, 345, 41.doi: 10.1056/NEJM200107053450107
(b) Di Bisceglie, A. M. Lancet 1998, 351, 351.
(c) Alter, M. J.; Kruszon-Moran, D.; Nainan, O. V.; McQuillan,G. M.; Gao, F.; Moyer, L. A.; Kaslow, R. A.; Margolis, H. S.N. Engl. J. Med. 1999, 341, 556.
(3) Manns, M. P.; McHutchison, J. G.; Gordon, S. C.; Rustgi, V. K.;Shiffman, M.; Reindollar, R.; Goodman, Z. D.; Koury, K.; Ling,M. H.; Albrecht, J. K. Lancet 2002, 347, 975.
(4) (a) Koch, U.; Narjes, F. Curr. Top. Med. Chem. 2007, 7, 1302.doi: 10.2174/156802607781212211
(b) Rönn, R.; Sandström, A. Curr. Top. Med. Chem. 2008, 8, 533.
(c) Zapf, C.W.; Bloom, J. D.; Levin, J. I. Ann. Rep. Med. Chem.2007, 42, 281.
(5) Appel, N.; Schaller, T.; Penin, F.; Bartenschlager, R. J. Biol. Chem. 2006, 281, 9833. doi: 10.1074/jbc.R500026200
(6) Ni, Z. J.;Wagman, A. S. Curr. Opin. Drug Discov. Dev. 2004, 7,446.
(7) Beaulieu, P. L.; Bos, M.; Bousquet, Y.; Fazal, G.; Gauthier, J.;Gillard, J.; Goulet, S.; LaPlante, S.; Poupart, M. A.; Lefebvre,S.; McKercher, G.; Pellerin, C.; Austel, V.; Kukolj, G. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 119. doi: 10.1016/j.bmcl.2003.10.023
(8) Stansfield, I.; Ercolani, C.; Mackay, A.; Conte, I.; Pompei, M.;Koch, U.; Gennari, N.; Giuliano, C.; Rowley, M.; Narjes, F.Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 627. doi: 10.1016/j.bmcl.2008.12.068
(9) Louise-May, S.; Yang,W.; Nie, X.; Liu, D.; Deshpande, M. S.;Phadke, A. S.; Huang, M.; Agarwal, A. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007, 17, 3905. doi: 10.1016/j.bmcl.2007.04.103
(10) Stankiewicz-Drogon, A.; Palchykovska, L. G.; Kostina, V. G.;Alexeeva, I. V.; Shved, A. D.; Boguszewska-Chachulska, A. M.Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 8846. doi: 10.1016/j.bmc.2008.08.074
(11) Bosse, T. D.; Larson, D. P.;Wagner, R.; Hutchinson, D. K.;Rockway, T.W.; Kati,W. M.; Liu, Y.; Masse, S.; Middleton, T.;Mo, H.; Montgomery, D.; Jiang,W.; Koev, G.; Kempf, D. J.;Molla, A. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 568. doi: 10.1016/j.bmcl.2007.11.088
(12) Lü,W. J.; Chen, Y. L.; Ma,W. P.; Zhang, X. Y.; Luan, F.; Liu,M. C.; Chen, X. G.; Hu, Z. D. Euro. J. Med. Chem. 2008, 43,569. doi: 10.1016/j.ejmech.2007.04.011
(13) Luan, F.; Liu, H. T.; Ma,W. P.; Fan, B. T. Euro. J. Med. Chem.2008, 43, 43. doi: 10.1016/j.ejmech.2007.03.002
(14) Melagraki, G.; Afantitis, A.; Sarimveis, H.; Koutentis, P. A.;Markopoulos, J.; Igglessi-Markopoulou, O. Bioorg. Med. Chem.2007, 15, 7237. doi: 10.1016/j.bmc.2007.08.036
(15) Su, L.; Li, L.; Li, Y.; Zhang, X.; Huang, X.; Zhai, H. Med. Chem. Res. 2012, 21, 2079. doi: 10.1007/s00044-011-9734-x
(16) de Vicente, J.; Hendricks, R. T.; Smith, D. B.; Fell, J. B.; Fischer,J.; Spencer, S. R.; Stengel, P. J.; Mohr, P.; Robinson, J. E.;Blake, J. F.; Hilgenkamp, R. K.; Yee, C.; Adjabeng, G.;Elworthy, T. R.; Li, J.;Wang, B.; Bamberg, J. T.; Harris, S. F.;Wong, A.; Leveque, V. J. P.; Najera, I.; Pogam, S. L.;Rajyaguru, S.; Ao-Ieong, G.; Alexandrova, L.; Larrabee, S.;Brandl, M.; Briggs, A.; Sukhtankar, S.; Farrell, R. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 5652. doi: 10.1016/j.bmcl.2009.08.022
(17) Hendricks, R. T.; Spencer, S. R.; Blake, J. F.; Fell, J. B.; Fischer,J.; Stengel, P. J.; Leveque, V. J. P.; Pogam, S. L.; Rajyaguru, S.;Najera, I.; Swallow, S. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 410.doi: 10.1016/j.bmcl.2008.11.060
(18) de Vicente, J.; Hendricks, R. T.; Smith, D. B.; Fell, J. B.; Fischer,J.; Spencer, S. R.; Stengel, P. J.; Mohr, P.; Robinson, J. E.;Blake, J. F.; Hilgenkamp, R. K.; Yee, C.; Adjabeng, G.;Elworthy, T. R.; Tracy, J.; Chin, E.; Li, J.;Wang, B.; Bamberg,J. T.; Stephenson, R.; Oshiro, C.; Harris, S. F.; Ghate, M.;Leveque, V.; Najera, I.; Pogam, S. L.; Rajyaguru, S.; Ao-Ieong,G.; Alexandrova, L.; Larrabee, S.; Brandl, M.; Briggs, A.;Sukhtankar, S.; Farrell, R.; Xu, B. Bioorg. Med. Chem. Lett.2009, 19, 3642. doi: 10.1016/j.bmcl.2009.05.004
(19) Hendricks, R. T.; Fell, J. B.; Blake, J. F.; Fischer, J. P.;Robinson, J. E.; Spencer, S. R.; Stengel, P. J.; Bernacki, A. L.;Leveque, V. J. P.; Pogam, S. L.; Rajyaguru, S.; Najera, I.; Josey,J. A.; Harris, J. R.; Swallow, S. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009,19, 3637. doi: 10.1016/j.bmcl.2009.04.119
(20) de Vicente, J.; Hendricks, R. T.; Smith, D. B.; Fell, J. B.; Fischer,J.; Spencer, S. R.; Stengel, P. J.; Mohr, P.; Robinson, J. E.;Blake, J. F.; Hilgenkamp, R. K.; Yee, C.; Zhao, J.; Elworthy, T.R.; Tracy, J.; Chin, E.; Li, J.; Lui, A.;Wang, B.; Oshiro, C.;Harris, S. F.; Ghate, M.; Leveque, V. J. P.; Najera, I.; Pogam, S.L.; Rajyaguru, S.; Ao-Ieong, G.; Alexandrova, L.; Fitch, B.;Brandl, M.; Masjedizadeh, M.;Wua, S. Y.; de Keczer, S.;Voronin, T. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 5648.doi: 10.1016/j.bmcl.2009.08.023
(21) Todeschini, R.; Consonni, V. Handbook of Molecular Descriptors;Wiley-VCH: New York, 2000.
(22) Xue, Y.; Li, Z. R.; Yap, C.W.; Sun, L. Z.; Chen, X.; Chen, Y. Z.J. Chem. Inform. Comp. Sci. 2004, 44, 1630. doi: 10.1021/ci049869h
(23) Tan, N. X.; Rao, H. B.; Li, Z. R.; Li, X. Y. SAR QSAR Environ. Res. 2009, 20, 27. doi: 10.1080/10629360902724085
(24) http://www.models.kvl.dk/source/GAPLS/index.asp, accessedJune 2008.
(25) Leardi, R.; Boggia, R.; Terrile, M. J. Chemom. 1992, 6, 267.
(26) Leardi, R. J. Chemom. 1994, 8, 65.
(27) Burbidge, R.; Trotter, M.; Buxton, B.; Holden, S. Comput. Chem. 2001, 26, 5. doi: 10.1016/S0097-8485(01)00094-8
(28) Cherkassky, V.; Ma, Y. Selection of Meta-parameters forSupport Vector Regression. Proceedings of the InternationalConference on Artificial Neural Networks, Madrid, Spain, Aug28-30, 2002.
(29) Hao, M.; Li, Y.;Wang, Y.; Zhang, S. Anal. Chim. Acta 2011,690, 53. doi: 10.1016/j.aca.2011.02.004
(30) Rainville, F. M. D.; Fortin, F. A.; Gardner, M. A.; Parizeau, M.;Gagné, C. DEAP: A Python Framework for EvolutionaryAlgorithms. In EvoSoft Workshop, Companion Proc. of theGenetic and Evolutionary Computation Conference, July 07-11,2012.
(31) Chang, C. C.; Lin, C. J. LIBSVM: A Library for Support VectorMachines, 2001. Software available at http://www.csie.ntu.edu.tw/-cjlin/libsvm, accessed Jun 2008. |