物理化学学报 >> 2010, Vol. 26 >> Issue (08): 2061-2072.doi: 10.3866/PKU.WHXB20100644
黄永棋, 刘志荣
收稿日期:
2010-02-03
修回日期:
2010-04-01
发布日期:
2010-07-23
通讯作者:
刘志荣
E-mail:LiuZhiRong@pku.edu.cn
基金资助:
国家自然科学基金(20973016、10721403)、国家重点基础研究发展计划项目(973) (2009CB918500)和教育部留学回国人员科研启动基金资助
HUANG Yong-Qi, LIU Zhi-Rong
Received:
2010-02-03
Revised:
2010-04-01
Published:
2010-07-23
Contact:
LIU Zhi-Rong
E-mail:LiuZhiRong@pku.edu.cn
Supported by:
The project was supported by the National Natural Science Foundation of China (20973016, 10721403), National Key Basis Research Program of China (973) (2009CB918500), and Scientific Research Foundation for the Returned Overseas Chinese Scholars, Ministry of Education, China.
摘要:
天然无序蛋白质是一类新发现的蛋白质, 它们在天然条件下没有确定的三维结构, 却具有正常的生物学功能, 广泛参与信号传递、DNA转录、细胞分裂和蛋白质聚集等重要的生理与病理过程. 无序蛋白质的发现是对传统的蛋白质“序列-结构-功能”范式的挑战. 在这篇综述里, 我们首先回顾了蛋白质的传统范式以及无序蛋白质的发现过程, 然后介绍无序蛋白质在结构、序列、功能等方面的特征与相互作用, 并以分子识别过程为例, 进一步阐述目前国际上对无序蛋白质所具有优势的一些认识与观点. 我们还分析了无序蛋白质研究在生命科学和医学等领域的应用前景, 并介绍了国内在无序蛋白质领域的研究现状.
黄永棋, 刘志荣. 天然无序蛋白质: 序列-结构-功能的新关系[J]. 物理化学学报, 2010, 26(08), 2061-2072. doi: 10.3866/PKU.WHXB20100644
HUANG Yong-Qi, LIU Zhi-Rong. Intrinsically Disordered Proteins: the New[J]. Acta Phys. -Chim. Sin. 2010, 26(08), 2061-2072. doi: 10.3866/PKU.WHXB20100644
[1]. Fischer, E. Ber. Dt. Chem. Ges., 1894, 27: 2985 [2]. Wu, H. Chin. J. Physiol., 1931, 1: 219 [3]. Mirsky, A. E.; Pauling, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1936, 22: 439 [4]. Uversky, V. N. Protein Sci., 2002, 11: 739 [5]. Dunker, A. K.; Brown, C. J.; Lawson, J. D.; Iakoucheva, L. M.; Obradovi, Z. Biochemistry, 2002, 41: 6573 [6]. Wright, P. E.; Dyson, H. J. J. Mol. Biol., 1999, 293: 321 [7]. Schweers, O.; Schénbrunn-Hanebeck, E.; Marx, A.; Mandelkow, E. J. Biol. Chem., 1994, 269: 24290 [8]. Sickmeier, M.; Hamilton, J. A.; LeGall, T.; Vacic, V.; Cortese, M. S.; Tantos, A.; Szabo, B.; Tompa, P.; Chen, J.; Uversky, V. N.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Nucleic Acids Res., 2007, 35: D786 [9]. Dunker, A. K.; Lawson, J. D.; Brown, C. J.; Williams, R. M.; Romero, P.; Oh, J. S.; Oldfield, C. J.; Campen, A. M.; Ratliff, C. M.; Hipps, K. W.; Ausio, J.; Nissen, M. S.; Reeves, R.; Kang, C.; Kissinger, C. R.; Bailey, R. W.; Griswold, M. D.; Chiu, W.; Garner, E. C.; Obradovic, Z. J. Mol. Graph. Model., 2001, 19: 26 [10]. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 2005, 6: 197 [11]. Eliezer, D. Curr. Opin. Struct. Biol., 2009, 19: 23 [12]. Receveur-Bréchot, V.; Bourhis, J. M.; Uversky, V. N.; Canard, B.; Longhi, S. Proteins, 2006, 62: 24 [13]. Fontana, A.; Zambonin, M.; de Laureto, P. P.; DeFilippis, V.; Clementi, A.; Scaramella, E. J. Mol. Biol., 1997, 266: 223 [14]. Iakoucheva, L. M.; Kimzey, A. L.; Masselon, C. D.; Bruce, J. E.; Garner, E. C.; Brown, C. J.; Dunker, A. K.; Smith, R. D.; Ackerman, E. J. Protein Sci., 2001, 10: 560 [15]. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Chem. Rev., 2004, 104: 3607 [16]. Muchmore, S. W.; Sattler, M.; Liang, H.; Meadows, R. P.; Harlan, J. E.; Yoon, H. S.; Nettesheim, D.; Chang, B. S.; Thompson, C. B.; Wong, S. L.; Ng, S. C.; Fesik, S. W. Nature, 1996, 381: 335 [17]. Li, C. G.; Charlton, L. M.; Lakkavaram, A.; Seagle, C.; Wang, G. F.; Young, G. B.; Macdonald, J. M.; Pielak, G. J. J. Am. Chem. Soc., 2008, 130: 6310 [18]. Yoon, M. K.; Venkatachalam, V.; Huang, A.; Choi, B. S.; Stultz, C. M.; Chou, J. J. Protein Sci., 2009, 18: 337 [19]. Radhakrishnan, I.; Pérez-Alvarado, G. C.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. FEBS Lett., 1998, 430: 317 [20]. Fuxreiter, M.; Simon, I.; Friedrich, P.; Tompa, P. J. Mol. Biol., 2004, 338: 1015 [21]. Csizm?仵k, V.; Bokor, M.; Bánki, P.; Klement, T.; Medzihradszky, K. F.; Friedrich, P.; Tompa, K. A.; Tompa, P. Biochemistry, 2005, 44: 3955 [22]. Fuxreiter, M.; Tompa, P.; Simon, I. Bioinformatics, 2007, 23: 950 [23]. Oldfield, C. J.; Cheng, Y. G.; Cortese, M. S.; Romero, P.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochemistry, 2005, 44: 12454 [24]. Mohan, A.; Oldfield, C. J.; Radivojac, P.; Vacic, V.; Cortese, M. S.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. J. Mol. Biol., 2006, 362: 1043 [25]. Mészáros, B.; Simon, I.; Dosztányi, Z. PLoS Comput. Biol., 2009, 5: e1000376 [26]. Radhakrishnan, I.; Pérez-Alvarado, G. C.; Parker, D.; Dyson, H. J.; Montminy, M. R.; Wright, P. E. Cell, 1997, 91: 741 [27]. Sugase, K.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Nature, 2007, 447: 1021 [28]. Tompa, P.; Fuxreiter, M. Trends Biochem. Sci., 2008, 33: 2 [29]. Dosztányi, Z.; Csizómk, V.; Tompa, P.; Simon, I. J. Mol. Biol., 2005, 347: 827 [30]. Ellis, R. J.; Minton, A. P. Nature, 2003, 425: 27 [31]. McNulty, B. C.; Young, G. B.; Pielak, G. J. J. Mol. Biol., 2006, 355: 893 [32]. Flaugh, S. L.; Lumb, K. J. Biomacromolecules, 2001, 2: 538 [33]. Mouillon, J. M.; Eriksson, S. K.; Harryson, P. Plant Physiol., 2008, 148: 1925 [34]. Dedmon, M. M.; Patel, C. N.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2002, 99: 12681 [35]. Croke, R. L.; Sallum, C. O.; Watson, E.; Watt, E. D.; Alexandrescu, A. T. Protein Sci., 2008, 17: 1434 [36]. Wang, W.; Xu, W. X.; Levy, Y.; Trizac, E.; Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2009, 106: 5517 [37]. Zhou, H. X. Arch. Biochem. Biophys., 2008, 469: 76 [38]. Meier, S.; Blackledge, M.; Grzesiek, S. J. Chem. Phys., 2008, 128: 052204 [39]. Shortle, D.; Ackerman, M. S. Science, 2001, 293: 487 [40]. Blackledge, M. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc., 2005, 46: 23 [41]. Jensen, M. R.; Markwick, P. R. L.; Meier, S.; Griesinger, C.; Zweckstetter, M.; Grzesiek, S.; Bernad?仵, P.; Blackledge, M. Structure, 2009, 17: 1169 [42]. Bernadó, P.; Mylonas, E.; Petoukhov, M. V.; Blackledge, M.; Svergun, D. I. J. Am. Chem. Soc., 2007, 129: 5656 [43]. Mittag, T.; Forman-Kay, J. D. Curr. Opin. Struct. Biol., 2007, 17: 3 [44]. Chen, H. M.; Rhoades, E. Curr. Opin. Struct. Biol., 2008, 18: 516 [45]. Huang, F.; Rajagopalan, S.; Settanni, G.; Marsh, R. J.; Armoogum, D. A.; Nicolaou, N.; Bain, A. J.; Lerner, E.; Haas, E.; Ying, L.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2009, 106: 20758 [46]. Hegedüs, T.; Serohijos, A. W. R.; Dokholyan, N. V.; He, L. H.; Riordan, J. R. J. Mol. Biol., 2008, 378: 1052 [47]. Solt, I.; Magyar, C.; Simon, I.; Tompa, P.; Fuxreiter, M. Proteins, 2006, 64: 749 [48]. Ganguly, D.; Chen, J. H. J. Am. Chem. Soc., 2009, 131: 5214 [49]. Smith, L. J. Methods, 2004, 34: 144 [50]. Huang, J. R.; Grzesiek, S. J. Am. Chem. Soc., 2010, 132: 694 [51]. Lindorff-Larsen, K.; Kristjansdottir, S.; Teilum, K.; Fieber, W.; Dobson, C. M.; Poulsen, F. M.; Vendruscolo, M. J. Am. Chem. Soc., 2004, 126: 3291 [52]. Mylonas, E.; Hascher, A.; Bernadó, P.; Blackledge, M.; Mandelkow, E.; Svergun, D. I. Biochemistry, 2008, 47: 10345 [53]. Choy, W. Y.; Forman-Kay, J. D. J. Mol. Biol., 2001, 308: 1011 [54]. Marsh, J. A.; Neale, C.; Jack, F. E.; Choy, W. Y.; Lee, A. Y.; Crowhurst, K. A.; Forman-Kay, J. D. J. Mol. Biol., 2007, 367: 1494 [55]. Marsh, J. A.; Forman-Kay, J. D. J. Mol. Biol., 2009, 391: 359 [56]. Romero, P.; Obradovic, Z.; Li, X. H.; Garner, E. C.; Brown, C. J.; Dunker, A. K. Proteins, 2001, 42: 38 [57]. Radivojac, P.; Iakoucheva, L. M.; Oldfield, C. J.; Obradovic, Z.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biophys. J., 2007, 92: 1439 [58]. Galzitskaya, O. V.; Garbuzynskiy, S. O.; Lobanov, M. Y. J. Phys.- Condes. Matter, 2007, 19: 285225 [59]. Romero, P.; Obradovic, Z.; Kissinger, C.; Villafranca, J. E.; Dunker, A. K. Proc. IEEE Int. Conf. Neural Networks, 1997, 1: 90 [60]. Ferron, F.; Longhi, S.; Canard, B.; Karlin, D. Proteins, 2006, 65: 1 [61]. He, B.; Wang, K. J.; Liu, Y. L.; Xue, B.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Cell Res., 2009, 19: 929 [62]. Prilusky, J.; Felder, C. E.; Zeev-Ben-Mordehai, T.; Rydberg, E. H.; Man, O.; Beckmann, J. S.; Silman, I.; Sussman, J. L. Bioinformatics, 2005, 21: 3435 [63]. Schlessinger, A.; Punta, M.; Rost, B. Bioinformatics, 2007, 23: 2376 [64]. Ward, J. J.; Sodhi, J. S.; McGuffin, L. J.; Buxton, B. F.; Jones, D. T. J. Mol. Biol., 2004, 337: 635 [65]. Linding, R.; Russell, R. B.; Neduva, V.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Res., 2003, 31: 3701 [66]. Linding, R.; Jensen, L. J.; Diella, F.; Bork, P.; Gibson, T. J.; Russell, R. B. Structure, 2003, 11: 1453 [67]. Coeytaux, K.; Poupon, A. Bioinformatics, 2005, 21: 1891 [68]. Yang, Z. R.; Thomson, R.; McNeil, P.; Esnouf, R. M. Bioinformatics, 2005, 21: 3369 [69]. Bryson, K.; McGuffin, L. J.; Marsden, R. L.; Ward, J. J.; Sodhi, J. S.; Jones, D. T. Nucleic Acids Res., 2005, 33: W36 [70]. Vullo, A.; Bortolami, O.; Pollastri, G.; Tosatto, S. C. E. Nucleic Acids Res., 2006, 34: W164 [71]. Shimizu, K.; Muraoka, Y.; Hirose, S.; Tomii, K.; Noguchi, T. BMC Bioinformatics, 2007, 8: 78 [72]. Galzitskaya, O. V.; Garbuzynskiy, S. O.; Lobanov, M. Y. Bioinformatics, 2006, 22: 2948 [73]. Noivirt-Brik, O.; Prilusky, J.; Sussman, J. L. Proteins, 2009, 77: 210 [74]. Liu, J. G.; Perumal, N. B.; Oldfield, C. J.; Su, E. W.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochemistry, 2006, 45: 6873 [75]. Iakoucheva, L. M.; Brown, C. J.; Lawson, J. D.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. J. Mol. Biol., 2002, 323: 573 [76]. Cheng, Y. G.; LeGall, T.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. Biochemistry, 2006, 45: 10448 [77]. Xie, H. B.; Vucetic, S.; Iakoucheva, L. M.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N.; Obradovic, Z. J. Proteome Res., 2007, 6: 1882 [78]. Galea, C. A.; Wang, Y.; Sivakolundu, S. G.; Kriwacki, R. W. Biochemistry, 2008, 47: 7598a [79]. Uversky, V. N. Frontiers Biosci., 2009, 14: 5188 [80]. Ji, L. N.; Du, H. N.; Zhang, F.; Li, H. T.; Luo, X. Y.; Hu, J.; Hu, H. Y. Protein J., 2005, 24: 209 [81]. Kang, N.; Chen, D.; Wang, L.; Duan, L.; Liu, S. R.; Tang, L.; Liu, Q. F.; Cui, L. X.; He, W. Cell. Mol. Immunol., 2008, 5: 333 [82]. Zhang, M. S.; Pickart, C. M.; Coffino, P. EMBO J., 2003, 22: 1488 [83]. Pena, M. M. O.; Melo, S. P.; Xing, Y. Y.; White, K.; Barbour, K. W.; Berger, F. G. J. Biol. Chem., 2009, 284: 31597 [84]. Liao, S. H.; Shang, Q.; Zhang, X. C.; Zhang, J. H.; Xu, C.; Tu, X. M. Biochem. J., 2009, 422: 207 [85]. Kriwacki, R. W.; Hengst, L.; Tennant, L.; Reed, S. I.; Wright, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1996, 93: 11504 [86]. Dames, S. A.; Martinez-Yamout, M.; De Guzman, R. N.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2002, 99: 5271 [87]. Elkins, J. M.; Hewitson, K. S.; McNeill, L. A.; Seibel, J. F.; Schlemminger, I.; Pugh, C. W.; Ratcliffe, P. J.; Schofield, C. J. J. Biol. Chem., 2003, 278: 1802 [88]. Dunker, A. K.; Cortese, M. S.; Romero, P.; Iakoucheva, L. M.; Uversky, V. N. FEBS J., 2005, 272: 5129 [89]. Haynes, C.; Oldfield, C. J.; Ji, F.; Klitgord, N.; Cusick, M. E.; Radivojac, P.; Uversky, V. N.; Vidal, M.; Iakoucheva, L. M. PLoS Comput. Biol., 2006, 2: e100 [90]. Singh, G. P.; Ganapathi, M.; Dash, D. Proteins, 2007, 66: 761 [91]. Patil, A.; Nakamura, H. FEBS Lett., 2006, 580: 2041 [92]. Tompa, P.; Szász, C.; Buday, L. Trends Biochem. Sci., 2005, 30: 484 [93]. Mészáros, B.; Tompa, P.; Simon, I.; Dosztányi, Z. J. Mol. Biol., 2007, 372: 549 [94]. Gunasekaran, K.; Tsai, C. J.; Kumar, S.; Zanuy, D.; Nussinov, R. Trends Biochem. Sci., 2003, 28: 81 [95]. Schreiber, G.; Haran, G.; Zhou, H. X. Chem. Rev., 2009, 109: 839 [96]. Shoemaker, B. A.; Portman, J. J.; Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97: 8868 [97]. Wang, J.; Zhang, K.; Lu, H. Y.; Wang, E. K. Phys. Rev. Lett., 2006, 96: 168101 [98]. Wang, J.; Zhang, K.; Lu, H. Y.; Wang, E. K. Biophys. J., 2006, 91: 866 [99]. Levy, Y.; Onuchic, J. N.; Wolynes, P. G. J. Am. Chem. Soc., 2007, 129: 738 [100]. Turjanski, A. G.; Gutkind, J. S.; Best, R. B.; Hummer, G. PLoS Comput. Biol., 2008, 4: e1000060 [101]. Crespin, M. O.; Boys, B. L.; Konermann, L. FEBS Lett., 2005, 579: 271 [102]. Huang, Y. Q.; Liu, Z. R. J. Mol. Biol., 2009, 393: 1143 [103]. Iakoucheva, L. M.; Radivojac, P.; Brown, C. J.; O′Connor, T. R.; Sikes, J. G.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Nucleic Acids Res., 2004, 32: 1037 [104]. Ferrell Jr., J. E. Trends Biochem. Sci., 1996, 21: 460 [105]. Borg, M.; Mittag, T.; Pawson, T.; Tyers, M.; Forman-Kay, J. D.; Chan, H. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104: 9650 [106]. Zor, T.; Mayr, B. M.; Dyson, H. J.; Montminy, M. R.; Wright, P. E. J. Biol. Chem., 2002, 277: 42241 [107]. Liu, J. T.; Faeder, J. R.; Camacho, C. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2009, 106: 19819 [108]. Singh, G. P.; Dash, D. Proteins, 2007, 68: 602 [109]. Shimizu, K.; Toh, H. J. Mol. Biol., 2009, 392: 1253 [110]. Staneva, I.; Wallin, S. J. Mol. Biol., 2009, 393: 1118 [111]. Hu, X.; Lee, M. S.; Wallqvist, A. Biochemistry, 2009, 48: 11158 [112]. Kleerekoper, Q. K.; Putkey, J. A. J. Biol. Chem., 2009, 284: 7455 [113]. Chen, X.; Solomon, W. C.; Kang, Y.; Cerda-Maira, F.; Darwin, K. H.; Walters, K. J. J. Mol. Biol., 2009, 392: 208 [114]. Wells, M.; Tidow, H.; Rutherford, T. J.; Markwick, P.; Jensen, M. R.; Mylonas, E.; Svergun, D. I.; Blackledge, M.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2008, 105: 5762 [115]. Vajda, S.; Weng, Z. P.; Rosenfeld, R.; DeLisi, C. Biochemistry, 1994, 33: 13977 [116]. Gupta, N.; Irbäck, A. J. Chem. Phys., 2004, 120: 3983 [117]. Wang, J.; Lu, Q.; Lu, H. P. PLoS Comput. Biol., 2006, 2: e78 [118]. Levy, Y.; Wolynes, P. G.; Onuchic, J. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2004, 101: 511 [119]. Verkhivker, G. M.; Bouzida, D.; Gehlhaar, D. K.; Rejto, P. A.; Freer, S. T.; Rose, P. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2003, 100: 5148 [120]. Chen, H. F.; Luo, R. J. Am. Chem. Soc., 2007, 129: 2930 [121]. Chen, H. F. J. Chem. Theory Comput., 2008, 4: 1360 [122]. Qin, F.; Chen, Y.; Li, Y. X.; Chen, H. F. J. Chem. Phys., 2009, 131: 115103 [123]. Wang, K. Y. Chem. Life, 2006, 26:199. [王克夷. 生命的化学, 2006, 26: 199] [124]. Chen, H. F. PLoS ONE, 2009, 4: e6516 [125]. Cao, Z. X.; Wang, J. H. J. Biomol. Struct. Dyn., 2010, 5: 651 [126]. Wang, J. H.; Cao, Z. X.; Li, S. Q. Curr. Comput. Aided Drug Des., 2009, 5: 280 [127]. Ng, K. P.; Potikyan, G.; Savene, R. O. V.; Denny, C. T.; Uversky, V. N.; Lee, K. A. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104: 479 [128]. Smith, L. J.; Fiebig, K. M.; Schwalbe, H.; Dobson, C. M. Folding Des., 1996, 1: R95 [129]. Adams, M.; Joachimiak, A.; Kim, R.; Montelione, G. T.; Norvell, J. J. Struct. Funct. Genomics, 2004, 5: 1 [130]. Bandaru, V.; Cooper, W.; Wallace, S. S.; Doublie, S. Acta Crystallogr. Sect. D-Biol. Crystallogr., 2004, 60: 1142 [131]. Lippow, S. M.; Tidor, B. Curr. Opin. Biotech., 2007, 18: 305 [132]. Floudas, C. A.; Fung, H. K.; McAllister, S. R.; Mõnigmann, M.; Rajgaria, R. Chem. Eng. Sci., 2006, 61: 966 [133]. Kim, D. E.; Blum, B.; Bradley, P.; Baker, D. J. Mol. Biol., 2009, 393: 249 [134]. Liu, S.; Liu, S. Y.; Zhu, X. L.; Liang, H. H.; Cao, A. N.; Chang, Z. J.; Lai, L. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104: 5330 [135]. Zheng, C. J.; Han, L. Y.; Yap, C. W.; Ji, Z. L.; Cao, Z. W.; Chen, Y. Z. Pharmacol. Rev., 2006, 58: 259 [136]. Chène, P. Mol. Cancer Res., 2004, 2: 20 [137]. Wasylyk, C.; Salvi, R.; Argentini, M.; Dureuil, C.; Delumeau, I.; Abecassis, J.; Debussche, L.; Wasylyk, B. Oncogene, 1999, 18: 1921 [138]. Chène, P.; Fuchs, J.; Bohn, J.; García-Echeverría, C.; Furet, P.; Fabbro, D. J. Mol. Biol., 2000, 299: 245 [139]. Vassilev, L. T. Cell Cycle, 2004, 3: 419 [140]. Best, J. L.; Amezcua, C. A.; Mayr, B.; Flechner, L.; Murawsky, C. M.; Emerson, B.; Zor, T.; Gardner, K. H.; Montminy, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2004, 101: 17622 [141]. Cheng, Y.; LeGall, T.; Oldfield, C. J.; Mueller, J. P.; Van, Y. Y. J.; Romero, P.; Cortese, M. S.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Trends Biotech., 2006, 24: 435 [142]. Cortese, M. S.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Prog. Biophys. Mol. Biol., 2008, 98: 85 [143]. Horn, J. R.; Kraybill, B.; Petro, E. J.; Coales, S. J.; Morrow, J. A.; Hamuro, Y.; Kossiakoff, A. A. Biochemistry, 2006, 45: 8488 [144]. Vamvaca, K.; Jelesarov, I.; Hilvert, D. J. Mol. Biol., 2008, 382: 971 |
[1] | 曹傲能. 蛋白质结构的“限域下最低能量结构片段”假说与蛋白质进化的“石器时代”[J]. 物理化学学报, 2020, 36(1): 1907002 - . |
[2] | 苏敏仪,刘慧思,林海霞,王任小. 应用机器学习方法构建药物分子解离速率常数的预测模型[J]. 物理化学学报, 2020, 36(1): 1907006 - . |
[3] | 张长胜,来鲁华. 生物分子液-液相分离的物理化学机制[J]. 物理化学学报, 2020, 36(1): 1907053 - . |
[4] | 高莎,兰文波,林英武,廖力夫,聂长明. 铀酰-Salophen受体对α, β-不饱和羰基化合物及手性客体的分子识别[J]. 物理化学学报, 2016, 32(3): 683 -690 . |
[5] | 李咏, 周玮, 代志军, 陈渊, 王志明, 袁哲明. 基于序列特征筛选与支持向量回归预测蛋白质折叠速率[J]. 物理化学学报, 2014, 30(6): 1091 -1098 . |
[6] | 杨乐乐, 刘佳, 李悦, 刘坤, 阮文娟. 手性糖基锌卟啉对手性氨基酸甲酯的分子识别[J]. 物理化学学报, 2013, 29(09): 1877 -1885 . |
[7] | 黄永棋, 康雪, 夏斌, 刘志荣. Mpro-C蛋白三维结构域交换的机理: 来自分子模拟的线索[J]. 物理化学学报, 2012, 28(10): 2411 -2417 . |
[8] | 张竹青. 全新设计蛋白质的折叠机制[J]. 物理化学学报, 2012, 28(10): 2381 -2389 . |
[9] | 张长胜, 来鲁华. 蛋白质相互作用预测、设计与调控[J]. 物理化学学报, 2012, 28(10): 2363 -2380 . |
[10] | 陈忠秀, 曹晨, 邓少平. 聚联乙炔囊泡负载的Bola型两亲分子识别三聚氰胺过程中Chaotrope促进型显色机制及热力学[J]. 物理化学学报, 2012, 28(06): 1320 -1328 . |
[11] | 支泽勇, 刘鹏程, 黄岩谊, 赵新生. 用于单分子动力学实验的微流控混合器[J]. 物理化学学报, 2011, 27(08): 1990 -1995 . |
[12] | 白红军, 来鲁华. 蛋白质相互作用: 界面分析, 结合自由能计算与相互作用设计[J]. 物理化学学报, 2010, 26(07): 1988 -1997 . |
[13] | 高萌, 姚新秋, 佘振苏, 刘志荣, 朱怀球. 蛋白折叠中的暂态结构与表面水分子慢尺度动力学[J]. 物理化学学报, 2010, 26(07): 1998 -2006 . |
[14] | 刘岳, 李晓琴, 徐海松, 乔辉. 蛋白质折叠类型的分类建模与识别[J]. 物理化学学报, 2009, 25(12): 2558 -2564 . |
[15] | 马世堂, 刘培勋, 龙伟, 禹洁, 徐阳. 血必净抗炎作用药效物质基础和多靶点作用效应[J]. 物理化学学报, 2009, 25(10): 2080 -2086 . |
|